腐朽对木材的力学和物理性质都有影响
木材属于容易腐朽、裂变的这点容忽视，因此防腐木如今十分受欢迎。木材的腐朽有很多种方式，无论是哪种形式的腐朽，腐朽后木材的化学组分均发生很大的变化，从而影响木材的各项物理和力学性质。但是，不同形式的腐朽，由于其分解的木材成分以及分解的程度和速度各不相同，因此对于力学性质的影响也是不同的。
比如褐腐菌主要分解木材内的纤维素和半纤维素，干朽菌侵害马尾松后，其纤维素含量可从原来的48%左右下降至1%，而木素和抽提物所占的比例明显增大。因此，如果木材发生腐朽，其强度将大大降低。木材的韧性和冲击强度对腐朽最为敏感，在木材腐朽的初期，刚能测到有质量损失的时候，其韧性已经降低到原来的三分之一到三分之二。
由于腐朽时木腐菌的菌丝在木材的细胞之间穿透，使木材内空隙增加，因此液体在木材内的渗透性增大。因此，在进行防腐处理时，腐朽材中所能进入的防腐剂的量可能远远高于健康材，容易造成防腐剂过量的现象。比如对于某种树种的健康材来说，它对防腐油的吸收率仅为14.1%，但是经过初期或中期腐朽后，其吸收率可高达163.9%。除了吸收量过高外，另外一个问题是腐朽材吸收的液体的量在同一批木材中容易出现不一致的情况。
另外，腐朽后的木材的吸水性和吸湿性要高于健康材，这样腐朽材的含水率通常高于健康材，更有利于腐朽菌的生长，形成恶性循环。
